El camino de CDSBMexico 2018 a BioC2019

Path to BioC2019

Hace un año la Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB) organizó un taller de una semana diseñado para entrenar a usuarios de R en como crear paquetes de R e idealmente compartirlos vía Bioconductor. El taller en sí fue todo un éxito basado en nuestro resumen del evento. Sin embargo, no queríamos parar ahí. Creamos la CDSB y juntamos fuerzas con los TIB (“Talleres Internacionales de Bioinformática”) de la NNB-UNAM con el objetivo de simular en conjunto un evento anual de BioC. En esos eventos los participantes pueden aprender a usar R, madurar como usarios de R y convertirse en desarrolladores de R. También organizamos el taller porque queríamos ver más Latinos en BioC.

Proceso de solicitud de beca para BioC2019

El tiempo siguió avanzando desde que completamos nuestro taller en 2018 y todo mundo regresó a sus trabajos normales o sus programas de maestría/doctorado. Luego anunciaron el congreso de BioC2019 y por lo mismo anunciaron los requerimientos para solicitar:

  • Presentar una plática o póster
  • Obtener una beca para ir al congreso
  • Proponer un taller

Básicamente, quienes querían solicitar la beca para el congreso tenían que:

  • Crear un sitio web o compartir su CV en algún lugar público
  • Responder en 150 palabras o menos la pregunta ¿Cómo has participado en el proyecto de Bioconductor en el pasado?
  • Responder en 150 palabras o menos la pregunta ¿Qué esperas obtener de la conferencia?
  • Escribir un resumen científico en 300 palabras o menos de tu trabajo que quisieras presentar en una plática o póster1.

Todo el proceso, a pesar de estar diseñado para que sea amigable, puede ser un poco abrumante si es tu primera vez mandando una solicitud de este estilo y si tu lengua nativa no es el inglés. Por lo tanto, cuando le recordamos a nuestros miembros sobre BioC2019 ofrecimos nuestra ayuda en todo este proceso.

Ayudando a miembros de la CDSB

Dada la experiencia que tienen con Bioconductor, Alejandro Reyes y Leonardo Collado Torres se ofrecieron de voluntarios para ayudar a miembros de la CDSB. El recordatorio en el blog y el contactar individualmente a varios participantes de CDSBMexico 2018 ayudaron a encontrar y motivar a miembros de la CDSB a que mandaran su solicitud. Simplemente animarlos y decirles que era realista que obtuvieran la beca hizo una gran diferencia. Es decir, creer en ellos y en el trabajo que todos hemos hecho en la comunidad. Hubieron muchos correos electrónicos, mensajes en canales de Slack y documentos que fueron compartidos, pero al final la versión más limpia del proceso fue la siguiente.

  1. Un miembro de la CDSB le hacía saber su interés en BioC2019 a un voluntario de la CDSB (Alejandro o Leonardo).
  2. Un voluntario le recordaba como funciona el proceso de solicitud de beca de BioC2019 y explicaba cualquier duda sobre el tema. De ser apropiado, el voluntario de CDSB también explicaba opciones para hacer páginas web gratis con GitHub.
  3. El miembro de la CDSB escribía su borrador de respuestas y resumen científico en un Google Doc que compartía con los voluntarios de la CDSB. Además, el miembro de CDSB les compartía su borrador de página web.
  4. Los voluntarios de la CDSB proveían sugerencias de cómo presentar la información más claramente para los revisores de la solicitud de beca. Las sugerencias eran hechas de tal forma que mantuvieran la idea general que quiso expresar el solicitante sobre ellos mismos o su trabajo.
  5. El miembro de la CDSB hacia modificaciones y de ser apropiado pedía otra ronda de sugerencias.

Básicamente, los voluntarios de la CDSB compartieron las mejores prácticas que conocen para llenar este tipo de solicitudes y para escribir resúmenes científicos, incluyendo los consejos que recientemente compartió Wolfgang Huber (uno de los primeros contribuidores al proyecto de Bioconductor).

El resultado final

Al final de todo, tres participantes de la CDSB completaron todo el proceso de solicitud de beca y crearon sus sitios web:

Todos enviaron su solicitud antes de la fecha límite del 15 de marzo del 2019, tal y como les insistimos que lo hicieran.

Pasaron varias semanas y el 2 de abril estuvimos encantados de compartir que a los tres les aprobaron pláticas 🎙de 10 minutos y becas para viajar al congreso ✈️. Esta noticia es una victoria enorme para la CDSB y nos da un empuje moral gigante 🎉🥳.

¡No podemos esconder lo contento que estamos con estas noticias y estamos emocionados de verlos en BioC2019! Esperamos que todos tengan una gran experiencia 🙌🏽😃

Unas palabras de los participantes de la CDSB que van a BioC2019

Como hemos dicho, esto es solo el inicio y queremos ayudar a otras personas en los años que siguen. Por lo tanto le pedimos a Ana, César y Joselyn que compartan unas palabras con los futuros participantes de la CDSB sobre el proceso de solicitud de beca de BioC2019 y el apoyo que obtuvieron de los voluntarios de la CDSB.

Ana

El proceso para aplicar y solicitar beca para BioC2019 no es tan difícil pero cuando leí los requerimientos por primera vez fue abrumador, no había publicado nunca una página web y era uno de los requerimientos, además, tenía que ser mi CV! Por un momento pensé que no aplicaría pero fue cuando Leo y Alejandro me animaron, les comenté que no tenía CV público y ellos muy amablemente me guiaron (ahora hago páginas web en R para todo lo que puedo, jeje). Ellos también estuvieron presentes ayudandome en los demás requisitos y al final disfruté la aplicación, les agradezco mucho el apoyo que me brindaron y espero con ansias verlos en NY. Definitivamente, Leo y Alejandro son muy serviciales e inspiradores y la comunidad CDSB es un lugar amistoso y comprometido con impulsar el desarrollo bioinformático de México para el mundo.

César

Cuando asistí a CDSB México 2018, lo último que imaginé fue que el proceso culminaría en una beca para BioC2019; El síndrome del impostor es algo completamente real. Al mencionarle mi proyecto de tesis tanto a Alejandro como a Leo, me alentaron a meterme de lleno e intentar de hacer una contribución a Bioconductor. Dicha tarea parecía demasiado complicada en un principio. No obstante, después de CDSB México 2018, mi perspectiva cambió enormemente. Un factor importante para decidirme a hacer la contribución y la consecuente aplicación para la conferencia, fue el apoyo sumamente constructivo que recibí de la comunidad en cada paso del proceso, partiendo desde mi idea original, hasta la aplicación misma. A través del proceso, noté que aún cuando frecuentemente esperamos tener un producto perfecto (una página personal, un CV en línea o un paquete de R y todo lo que lo acompaña) desde un inicio, rara vez sucede así. Podra sonar cliché, pero Roma no fue construido en un dia. Ser capaz de cambiar mi perspectiva y reconocer la naturaleza incremental de contribuir ha creado un precedente para lidiar con las tareas relacionadas a mi progresión profesional de ahora en adelante; Ojalá que sea mediante contribuciones al proyecto Bioconductor y el dominio open-source! Si hay algo que tengo que decirle a futuros candidatos y miembros de la CDSB es eso: Hazlo! Involucrate! Aplica sabiendo que la comunidad está aquí para ti! Con un poco de suerte y arduo esfuerzo, las cosas se te pueden acomodar, justo como se me acomodaron a mi.

Joselyn

Cuando Alejandro Reyes y Leonardo Collado me contactaron me sentí nerviosa, ya que no había considerado la posibilidad de presentar mi trabajo y mucho menos aplicar a una beca para asistir a BioC2019 antes de recibir su correo. Ellos me dieron su invaluable confianza y apoyo durante todo el proceso. Ahora que he sido seleccionada para participar en este gran evento y que he sido beneficiada con la beca para asistir, me siento muy emocionada y me doy cuenta de lo unida que es la comunidad CDSBMexico. Ahora sé que es posible ser parte de esta gran comunidad y asistir a eventos como BioC2019, sólo hace falta perder el miedo.


  1. También era válido proponer un taller, pero eso es demasiado para alguien que apenas va empezar su aventura con Bioconductor. Es más bien para los que ya son veteranos de BioC. ^
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Leonardo Collado-Torres, PhD
Científico de Datos II

Brain genomics #rstats coder working w/ @andrewejaffe @LieberInstitute. @lcgunam @jhubiostat @jtleek alumni. @LIBDrstats @CDSBMexico co-founder.

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