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El impacto de la CDSB en mí

Por Erick Cuevas Fernández, M. en C., Bioinformático. Universidad Nacional Autónoma de México. Universidad Autónoma del Estado de Morelos. Laboratorio de Biología de Sistemas y Medicina Traslacional. @ErickCuevasF En 2018 escuché de un workshop donde Martin Morgan se presentaba en México, en ese entonces solo tenía unos cuantos meses aprendiendo a usar R. En tiempo desconocía quién era Martin Morgan y tenía vagas nociones de Bioconductor. Ese año inicié a tomar los talleres internacionales de bioinformática.

Comunidades de Práctica en América Latina: R y Colegas

Esta sesión de useR!2020 y video fueron organizados por Laura Acion, Yanina Bellini Saibene, Paola Corrales y Paloma Rojas Saunero. Leonardo Collado Torres coordinó el blog post. Este blog post fue originalmente publicado en el blog del R Consortium el 7 de julio del 2020. El 19 de junio de 2020 filmamos un video para useR!2020 donde resaltamos las comunidades y organizaciones en América Latina en las que estamos involucradxs o que tienen participantes latinxs.

CDSB: la historia de una comunidad diversa y de superación en México que aspira a empoderar a desarrolladores locales de R

Esta entrada en el blog fue enviada al blog del R Consortium donde fue publicada el 03/18/2020. He ido a congresos de R desde 2008, y mientras he visto a la comunidad de R crecer rápidamente, generalmente no me topo con otras, otros y otrxs desarrolladores latinoamericanos (LatAm) en las diferentes comunidades de desarrolladores de R. Tradicionalmente, la, el o lxs investigadores líderes de un laboratorio inmerso con R o Bioconductor le enseñarían a sus alumnos, alumnas, alumnxs y aprendices estas habilidades, convirtiéndose así en un nodo local de la comunidad de R.

Taller CDSB 2020: Construyendo flujos de trabajo con RStudio y Bioconductor para datos transcriptómicos de célula única (scRNA-seq)

Este taller es parte del Encuentro de Bioinformática en México (EBM) 2020 organizado por la CDSB junto con: TIB2020 RMB NNB CCG-UNAM Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB) Página del taller Nivel: intermedio - avanzado Languaje: español Cuando: Agosto 3 - Agosto 7, 2020 (9 am a 5:30 pm excepto el viernes que será hasta las 2:30 pm)

De usuarios de Bioconductor a desarrolladores: nuestro primer paquete

Hace un par de años creamos la Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB) porque estabamos consternados con la baja representación de Latino Americanos en la comunidad de Bioconductor y la comunidad de R en general. Para la historia completa checa este blog post. Desde que creamos la CDSB, un objetivo central ha sido el ayudar a los usarios de Bioconductor en volverse desarrolladores de Bioconductor. Para lograr este objetivo, hemos organizado talleres de una semana en México de bajo costo durante los veranos de 2018 and 2019 en conjunto con los TIBs (NNB-UNAM) y la RMB.

Taller CDSB 2019: Cómo Crear y Ordenar Herramientas 'Tidy'

Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática Página del taller: https://comunidadbioinfo.github.io/es/post/building-tidy-tools-CDSB-runconf-2019/ Nivel: intermedio - avanzado Languaje: español^[If you speak English but not Spanish please let us know so we can plan accordingly.] Cuando: Julio 29 - Augusto 2, 2018 Donde: Auditorio del Centro de Ciencias Genómicas, Cuernavaca, Mexico Twitter: #CDSBMexico Facebook: @CDSBMexico GitHub: https://github.com/ComunidadBioInfo/tidy-tools-CDSB-runconf-2019

El camino de CDSBMexico 2018 a BioC2019

Hace un año la Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB) organizó un taller de una semana diseñado para entrenar a usuarios de R en como crear paquetes de R e idealmente compartirlos vía Bioconductor. El taller en sí fue todo un éxito basado en nuestro resumen del evento. Sin embargo, no queríamos parar ahí. Creamos la CDSB y juntamos fuerzas con los TIB (“Talleres Internacionales de Bioinformática”) de la NNB-UNAM con el objetivo de simular en conjunto un evento anual de BioC.

CDSBMexico: acuerdense de solicitar becas para ir a BioC2019

About 10 months ago we announced our plans to start a new community of R/Bioconductor developers in Mexico and Latin America. The National Bioinformatics Node ( NNB-UNAM in Spanish) has organized workshops in bioinformatics and R since 2006 and more frequently since 2010. Last year, 2018, there were five simultaneous one week workshops: Introduction to R and RStudio Exploratory data analysis (EDA) of biological data with R

Un resumen de CDSB 2018: el inicio de una comunidad

Organizing an event is a lot of work, much more than you plan for it. But harvesting the fruits of a successful event makes the workload worth it. In July, we kicked off the first Bioconductor Latin American Developers Workshop 2018 (LatAmBioc2018). The main goals of this meeting were to encourage the development of the Bioconductor project in Mexico and to start a community of Mexican bioinformatic software developers – the Community of Bioinformatic Software Developers (CDSB, from its acronym in Spanish).

R Gene Regulatory Interaction Formulator For Inquiring Networks

This blog post was written by ME Martinez-Sanchez, S Muñoz, M Carrillo, E Azpeitia, D Rosenblueth. In this blog post we will describe the package rGriffin (Martinez-Sanchez, Muñoz, Carrillo, Azpeitia, et al., 2018) that was one of the projects developed during the TIB2018-BCDW. We hope to continue developing Griffin and rGriffin (Martinez-Sanchez, Muñoz, Carrillo, Azpeitia, et al., 2018). If you have ideas, suggestions or bugs, please contact us via rGriffin GitHub repo.