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CDSB

Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática

Visión general

¡Bienvenidos a la Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB)!

Somos un grupo interesado en ayudarle a miembros de países Latino Americanos en el proceso de acquirir las habilidades necesarias para contribuir a la comunidad de software libre. Hoy en día se usa R en muchas industrias y desde el inicio fue adoptado por académicos. Mientras los usuarios de R van familiarizandose con el lenguaje terminan escribiendo funciones que luego son agrupadas y compartidas vía paquetes. Estos paquetes son distribuidos vía GitHub o vía repositorios más formales como lo son CRAN y Bioconductor. Bioconductor es un proyecto centrado alrededor de software libre para la bioinformática hecho con R y ha sido de gran utilidad para varios de nosotros. Como parte de la CDSB buscamos aumentar la representación de países Latino Americanos en las comunidades de desarrolladores de software libre y de esa forma aumentar su diversidad. Por lo tanto, nuestro objetivo principal es enseñarle a Latino Americanos como hacer paquetes de R para que los compartan vía GitHub, CRAN y Bioconductor.

Intereses

  • R
  • Bioinformática
  • Educación
  • Diversidad

Habilidades

que nos unen

R

Bioinformática

Educación

Comunidad

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Equipo

de trabajo

Comunidad

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CDSB

Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática

R, Bioinformática, Educación, Diversidad

Junta Directiva

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Erick Cuevas-Fernández, MC

Estudiante de Doctorado

R, Trastornos Mentales, Aprendizaje de Máquina

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Leonardo Collado-Torres, PhD

Investigador

Genómica, Programación con R, Bioestadística, Educación, Diversidad

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Alejandro Reyes, PhD

Postdoc

Ciencia de Datos, Genómica, R, Estadística

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Alejandra Medina Rivera, PhD

Investigadora Asociada

Regulación Génica, Bioinformática

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Heladia Salgado Osorio

Técnico Académico

Bioinformática, Educación

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Joselyn Chavez, Candidata a Doctorado

Candidata a Doctorado

Bioinformática, Programación en R, Bioconductor, Genética

Fundadores

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Leonardo Collado-Torres, PhD

Investigador

Genómica, Programación con R, Bioestadística, Educación, Diversidad

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Alejandro Reyes, PhD

Postdoc

Ciencia de Datos, Genómica, R, Estadística

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Delfino García-Alonso

Técnico Académico

Bioinformática

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Alejandra Medina Rivera, PhD

Investigadora Asociada

Regulación Génica, Bioinformática

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Heladia Salgado Osorio

Técnico Académico

Bioinformática, Educación

Exalumnos Desarrolladores de Bioconductor

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Carmina Barberena-Jonas

Estudiante Interno

Mexican Biobank, Bioinformática, Programación en R, Bioconductor, Fotografía, Pinturas surrealistas

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Jesus Emiliano Sotelo-Fonseca

Estudiante de Maestría

Biotechnología de Plantas, Bioinformática, Programación en R, Bioconductor

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Joselyn Chavez, Candidata a Doctorado

Candidata a Doctorado

Bioinformática, Programación en R, Bioconductor, Genética

Instructores 2020

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Leonardo Collado-Torres, PhD

Investigador

Genómica, Programación con R, Bioestadística, Educación, Diversidad

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Alejandro Reyes, PhD

Postdoc

Ciencia de Datos, Genómica, R, Estadística

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Alejandra Medina Rivera, PhD

Investigadora Asociada

Regulación Génica, Bioinformática

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Joselyn Chavez, Candidata a Doctorado

Candidata a Doctorado

Bioinformática, Programación en R, Bioconductor, Genética

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Marcel Ramos Perez, MPH

Miembro del equipo central de Bioconductor

Desarollo de paquetes Bioconductor, Genómica, Integración de datos, Bioestadística

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Maria Teresa Ortiz, MA

Científica de Datos

Modelaje estadístico (modelos jerárquicos, estadística espacial, redes Bayesianas), Diseño de encuestas y su análisis, Aprendizaje automático, Visualicación de datos

Instructores 2019

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Leonardo Collado-Torres, PhD

Investigador

Genómica, Programación con R, Bioestadística, Educación, Diversidad

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Alejandro Reyes, PhD

Postdoc

Ciencia de Datos, Genómica, R, Estadística

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Alejandra Medina Rivera, PhD

Investigadora Asociada

Regulación Génica, Bioinformática

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Maria Teresa Ortiz, MA

Científica de Datos

Modelaje estadístico (modelos jerárquicos, estadística espacial, redes Bayesianas), Diseño de encuestas y su análisis, Aprendizaje automático, Visualicación de datos

Instructores 2018

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Leonardo Collado-Torres, PhD

Investigador

Genómica, Programación con R, Bioestadística, Educación, Diversidad

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Alejandro Reyes, PhD

Postdoc

Ciencia de Datos, Genómica, R, Estadística

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Alejandra Medina Rivera, PhD

Investigadora Asociada

Regulación Génica, Bioinformática

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Alejandro Ponce-Mendoza, PhD

Investigador

Ecología Numérica, Visualización de Datos, Agrobiodiversidad

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Benilton S Carvalho, PhD

Profesor Investigador

Biología Computacional, Bioinformática, Microarreglos, NGS, HPC

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Maria Teresa Ortiz, MA

Científica de Datos

Modelaje estadístico (modelos jerárquicos, estadística espacial, redes Bayesianas), Diseño de encuestas y su análisis, Aprendizaje automático, Visualicación de datos

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Martin Morgan, PhD

Profesor de Oncología

Métodos estadísticos para biología computacional

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Selene L. Fernandez-Valverde, PhD

Líder de Grupo

ARN no codificante, Bioinformática, Genómica Comparativa, ARNs Pequeños, Regulación Génica

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