Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor.
Bienvenida
Les damos la bienvenida al Workshop Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor!
En este taller aprenderás cuáles son los pasos cruciales para desarrollar un paquete de R y algunas buenas prácticas para la generación de código. Con la integración de estas herramientas, tendrás la oportunidad de crear tu primer paquete y contribuir a la comunidad de desarrolladores.
0.1 Instructores
- Dra. Joselyn Cristina Chávez Fuentes: Estancia Postdoctoral en Icahn School of Medicine at Mount Sinai.
- Dra. Mirna Vázquez Rosas Landa: Investigadora en el Instituto de Ciencias de Mar y Limnología de la UNAM.
- Dra. Alejandra Medina Rivera: Investigadora Asociada en el Laboratorio Internacional de Investigación de Medicina Genómica, UNAM.
- M.C. Erick Cuevas Fernández: Estudiante de Doctorado en la Universidad Nacional Autónoma de México.
0.2 Temario
Consulta el calendario de este curso en: https://bit.ly/calendarcdsb2024
- Día 1: Flujo de trabajo orientado a proyectos:
- Introducción al flujo de trabajo orientado a proyectos.
- Paths seguros.
- Buenas prácticas de configuración y mantenimiento de espacios de trabajo.
- Modificando los archivos de inicio de R.
- Nuevas funcionalidades de RStudio, Quarto.
- Día 2: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte I
- Control de versiones con GitHub y RStudio.
- Solución de problemas con las versiones de paquetes de Rstudio.
- Infraestructura de un paquete de R/Bioconductor.
- Plática: Convirtiendo tu flujo de análisis en un paquete de R/Bioconductor.
- Documentación de funciones.
- Sesión social: Conociendo a la comunidad.
- Día 3: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte II
- Diseño de pruebas.
- Creación de viñetas.
- Compilación e instalación de paquetes.
- Proyectos colaborativos Parte I.
- Día 4: Proyectos colaborativos
- Proyectos colaborativos Parte II.
- Presentación de proyectos.
- Clausura.
0.4 Licencia
Este material posee una licencia tipo Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.
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