Bienvenida

Les damos la bienvenida al Workshop Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor!

En este taller aprenderás cuáles son los pasos cruciales para desarrollar un paquete de R y algunas buenas prácticas para la generación de código. Con la integración de estas herramientas, tendrás la oportunidad de crear tu primer paquete y contribuir a la comunidad de desarrolladores. Adicionalmente, aprenderás a crear un sitio web para mostrar el funcionamiento de un paquete de R.

0.1 Instructores

Dra. Joselyn Cristina Chávez Fuentes: Estancia Postdoctoral en Icahn School of Medicine at Mount Sinai.
Dra. Alejandra Medina Rivera: Investigadora Asociada en el Laboratorio Internacional de Investigación de Medicina Genómica, UNAM.
Dra. Yalbi I. Balderas-Martínez: Investigadora en el Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas.
Dra. Mirna Vázquez Rosas Landa: Investigadora en el Instituto de Ciencias de Mar y Limnología de la UNAM.
M.C. Erick Cuevas Fernández: Estudiante de Doctorado en la Universidad Nacional Autónoma de México.
M.C. José Antonio Ovando Ricárdez: Estudiante de Doctorado en el Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas.

0.2 Ayudantes

Dra. Evelia Coss: Posdoctoral en el Laboratorio Internacional de Investigación de Medicina Genómica, UNAM.
M.C. José Antonio Ovando Ricárdez: Estudiante de Doctorado en el Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas.

0.3 Temario

Consulta el calendario de este curso en: https://bit.ly/calendarcdsb2024

Día 1: Flujo de trabajo orientado a proyectos:
- Introducción al trabajo con proyectos de RStudio.
- Paths seguros.
- Control de versiones con GitHub y RStudio.
- Solución de problemas con las versiones de paquetes de Rstudio.
Día 2: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte I
- Infraestructura de un paquete de R/Bioconductor.
- Documentación de funciones.
- Sesión social: Conociendo a la comunidad.
- Proyectos colaborativos Parte I.
Día 3: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte II
- Diseño de pruebas.
- Creación de viñetas.
- Compilación e instalación de paquetes.
- Proyectos colaborativos Parte II.
Día 4: Creación de sitios web para la documentación de paquetes de R
- Creación de sitios web con pkgdown
- Proyectos colaborativos Parte III.
- Presentación de proyectos.
- Clausura.