Taller de Desarrolladores Latino Americanos de R/BioConductor 2018

Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática

• Página del taller: https://comunidadbioinfo.github.io/post/r-bioconductor-developers-workshop-2018/

• Nivel: intermedio - avanzado

• Languaje: ínglés

• Cuando: Julio 30 - Augusto 3, 2018

• Donde: Auditorio del  Centro de Ciencias Genómicas, Cuernavaca, Mexico

• Twitter: #CDSBMexico

• Facebook: @CDSBMexico

• GitHub:  https://github.com/ComunidadBioInfo/R-BioConductor-Developers-Workshop-2018

• Regístrate

Pre-requisitos

Requisitos de conocimientos previos

• Los participantes deberán tener conocimientos básicos del lenguaje de programación R: asignación de variables, lectura de archivos: read.csv, read.delim, read.table; estructuras de datos: matrix, dataframe, list; tipos de datos: character, numeric, factor, logical, etc; instalación y uso de paquetes.

• Saber instalar paquetes de R.

• Saber usar RStudio.

Requisitos técnicos

• Computadora Personal Un mínimo de 8 GB de RAM, un ratón y espacio de disco suficiente para archivos de texto y archivos de imagen. Privilegios de administrador para instalar y ejecutar utilidades de RStudio.

Introducción

En años recientes, la biología ha visto un aumento en el uso de tecnologías que permiten generar datos de forma masiva, cuantitativa y que permiten hacer perfiles de estados celulares. Como resultado, el campo ahora se enfrenta con retos relacionados a la cantidad de datos. El proyecto de R/ Bioconductor es una plataforma para compartir software libre que provee de herramientas para traducir la complejidad de los datos en conocimiento biológico.

Este taller está enfocado hacia alumnos e investigadores interesados en analizar datos biológicos. Queremos promover solicitudes de expertos en diversas disciplinas, incluyendo mas no limitandonos a biológos, bioinformáticos, científicos de datos, ingenieros de software, programadores y usuarios de R en general. Los principales objetivos del taller son:

1. Enseñarle a los participantes los principios de la ciencia de datos vía el desarrollo de paquetes de R/Bioconductor.

2. Transformar usuarios de software de bioinformática en desarrolladores de software de bioinformática.

3. Fomentar el intercambio de conocimiento y establecer colaboraciones multidisciplinarias.

4. Crear una comunidad de científicos Latino Americanos comprometidos con el desarrollo de software para análisis de datos biológicos.

5. Entrenar a instructores en bioinformática para que puedan fomentar el crecimiendo de sus comunidades locales.

Este taller es parte de un proyecto a largo plazo para crear una comunidad Latino Americana de desarrolladores de software. Esperamos poder organizar talleres en el futuro de forma sistemática (similar a BioC, EuroBioC y BioCAsia) donde los participantes presenten sus contribuciones de software. Queremos proveer un ambiente amigable para todos así que les pedimos que sigan el código de conducta.

Programa

Materiales

Instructores:

• Martin Morgan (Roswell Park Comprehensive Cancer Center, Buffalo, USA)

• Benilton Carvalho (University of Campinas, Campinas, Brazil)

• Selene L. Fernandez-Valverde (National Laboratory of Genomics for Biodiversity, Irapuato, Mexico)

Comité organizador:

• Heladia Salgado (Center for Genomic Sciences, Cuernavaca, Mexico)

• Leonardo Collado-Torres (Lieber Institute for Brain Development, Baltimore, USA)

• Alejandra Medina-Rivera (International Laboratory for Human Genome Research, Juriquilla, Mexico)

• Alejandro Reyes (Dana-Farber Cancer Institute, Boston, USA)

• Delfino García (Center for Genomic Sciences, Cuernavaca, Mexico)

• Daniela Ledezma-Tejeida (Center for Genomic Sciences, Cuernavaca, Mexico)

• Laura Gómez (Center for Genomic Sciences, Cuernavaca, Mexico)

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